Repurposing small RNA from ciliates for genome editing: single-molecule study

the road to next-generation single-molecule biophysics (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Severins, I.W.H.; Joo, C.; Noort, S.J.T. van
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 4, 2022, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.024

RNA-guided RNA silencing by an Asgard archaeal Argonaute (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Carolien Bastiaanssen, Pilar Bobadilla Ugarte, Kijun Kim, Giada Finocchio, Yanlei Feng, Todd A. Anzelon, Stephan Köstlbacher, Daniel Tamarit, Thijs J. G. Ettema, Martin Jinek, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Daan C. Swarts & Fabai Wu
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, Page(s) 5499, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49452-1

mRNA structural dynamics shape Argonaute-target interactions (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Suzan Ruijtenberg, Stijn Sonneveld, Tao Ju Cui, Ive Logister, Dion de Steenwinkel, Yao Xiao, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Marvin E. Tanenbaum
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 27/9, 2020, Page(s) 790-801, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0461-1

High-Speed Super-Resolution Imaging Using Protein-Assisted DNA-PAINT (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Mike Filius, Tao Ju Cui, Adithya N. Ananth, Margreet W. Docter, Jorrit W. Hegge, John van der Oost, Chirlmin Joo
Publié dans: Nano Letters, Numéro 20/4, 2020, Page(s) 2264-2270, ISSN 1530-6984
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.9b04277

FRET-based dynamic structural biology: Challenges, perspectives and an appeal for open-science practices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Lerner, Eitan; Barth, Anders; Hendrix, Jelle; Ambrose, Benjamin; Birkedal, Victoria; Blanchard, Scott C.; Börner, Richard; Chung, Hoi Sung; Cordes, Thorben; Craggs, Timothy D.; Deniz, Ashok A.; Diao, Jiajia; Fei, Jingyi; Gonzalez, Ruben L.; Gopich, Irina V.; Ha, Taekjip; Hanke, Christian A.; Haran, Gilad; Hatzakis, Nikos S.; Hohng, Sungchul; Hong, Seok Cheol; Hugel, Thorsten; Ingargiola, Antonino
Publié dans: eLife, Numéro 2, 2021, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60416

Argonaute bypasses cellular obstacles without hindrance during target search (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Tao Ju Cui, Misha Klein, Jorrit W. Hegge, Stanley D. Chandradoss, John van der Oost, Martin Depken, Chirlmin Joo
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12415-y

Targeting G-quadruplex Forming Sequences with Cas9 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Hamza Balci; Hamza Balci; Viktorija Globyte; Chirlmin Joo
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 2, 2021, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2020.09.19.304816

Small RNA-directed DNA elimination: the molecular mechanism and its potential for genome editing. (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: C.K.J.M.L. Bastiaanssen; Chirlmin Joo
Publié dans: RNA Biology, Numéro 2, 2021, ISSN 1547-6286
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2021.1885208